Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CACNA1DQ01668 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms