Protein–RNA interactions for Protein: Q00888

PSG4, Pregnancy-specific beta-1-glycoprotein 4, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSG4Q00888 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PSG4Q00888 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms