Protein–RNA interactions for Protein: P62987

UBA52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA52P62987 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
UBA52P62987 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA52P62987 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA52P62987 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA52P62987 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA52P62987 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA52P62987 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA52P62987 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA52P62987 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA52P62987 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA52P62987 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA52P62987 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA52P62987 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA52P62987 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA52P62987 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA52P62987 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA52P62987 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA52P62987 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA52P62987 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA52P62987 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA52P62987 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA52P62987 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA52P62987 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA52P62987 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA52P62987 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA52P62987 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA52P62987 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA52P62987 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA52P62987 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA52P62987 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA52P62987 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA52P62987 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA52P62987 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA52P62987 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA52P62987 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA52P62987 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA52P62987 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA52P62987 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
UBA52P62987 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
UBA52P62987 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms