Protein–RNA interactions for Protein: P60900

PSMA6, Proteasome subunit alpha type-6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA6P60900 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 Metazoa_SRP.96-201ENST00000621315 318 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
PSMA6P60900 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
PSMA6P60900 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms