Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CTBP2P56545 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms