Protein–RNA interactions for Protein: P54289

CACNA2D1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1P54289 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA2D1P54289 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms