Protein–RNA interactions for Protein: P51956

NEK3, Serine/threonine-protein kinase Nek3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK3P51956 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEK3P51956 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEK3P51956 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEK3P51956 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEK3P51956 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEK3P51956 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEK3P51956 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEK3P51956 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEK3P51956 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEK3P51956 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
NEK3P51956 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEK3P51956 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEK3P51956 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEK3P51956 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEK3P51956 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEK3P51956 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEK3P51956 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEK3P51956 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEK3P51956 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
NEK3P51956 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEK3P51956 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEK3P51956 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEK3P51956 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEK3P51956 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEK3P51956 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEK3P51956 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEK3P51956 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEK3P51956 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NEK3P51956 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEK3P51956 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEK3P51956 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEK3P51956 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEK3P51956 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NEK3P51956 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEK3P51956 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEK3P51956 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEK3P51956 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEK3P51956 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEK3P51956 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEK3P51956 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEK3P51956 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEK3P51956 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEK3P51956 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEK3P51956 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NEK3P51956 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NEK3P51956 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEK3P51956 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEK3P51956 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEK3P51956 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEK3P51956 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEK3P51956 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEK3P51956 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEK3P51956 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEK3P51956 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEK3P51956 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEK3P51956 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEK3P51956 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NEK3P51956 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms