Protein–RNA interactions for Protein: P48163

ME1, NADP-dependent malic enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME1P48163 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ME1P48163 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ME1P48163 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ME1P48163 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ME1P48163 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ME1P48163 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ME1P48163 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ME1P48163 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ME1P48163 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ME1P48163 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ME1P48163 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ME1P48163 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ME1P48163 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ME1P48163 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ME1P48163 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ME1P48163 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
ME1P48163 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ME1P48163 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
ME1P48163 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ME1P48163 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
ME1P48163 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ME1P48163 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ME1P48163 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ME1P48163 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ME1P48163 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ME1P48163 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
ME1P48163 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ME1P48163 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
ME1P48163 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ME1P48163 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ME1P48163 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ME1P48163 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ME1P48163 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
ME1P48163 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ME1P48163 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ME1P48163 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ME1P48163 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ME1P48163 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ME1P48163 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ME1P48163 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ME1P48163 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ME1P48163 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ME1P48163 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ME1P48163 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ME1P48163 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ME1P48163 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ME1P48163 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ME1P48163 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ME1P48163 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ME1P48163 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ME1P48163 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
ME1P48163 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ME1P48163 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ME1P48163 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ME1P48163 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
ME1P48163 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
ME1P48163 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ME1P48163 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ME1P48163 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ME1P48163 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ME1P48163 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ME1P48163 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ME1P48163 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ME1P48163 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ME1P48163 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ME1P48163 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ME1P48163 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ME1P48163 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ME1P48163 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ME1P48163 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ME1P48163 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ME1P48163 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ME1P48163 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ME1P48163 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ME1P48163 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ME1P48163 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ME1P48163 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ME1P48163 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ME1P48163 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ME1P48163 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ME1P48163 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
ME1P48163 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ME1P48163 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ME1P48163 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ME1P48163 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ME1P48163 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ME1P48163 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ME1P48163 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ME1P48163 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ME1P48163 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ME1P48163 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ME1P48163 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ME1P48163 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ME1P48163 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ME1P48163 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ME1P48163 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ME1P48163 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ME1P48163 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ME1P48163 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ME1P48163 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms