Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCCP43146 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCCP43146 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCCP43146 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCCP43146 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCCP43146 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCCP43146 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCCP43146 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCCP43146 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCCP43146 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCCP43146 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCCP43146 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCCP43146 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCCP43146 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCCP43146 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCCP43146 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCCP43146 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCCP43146 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DCCP43146 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCCP43146 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCCP43146 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
DCCP43146 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
DCCP43146 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCCP43146 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCCP43146 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCCP43146 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCCP43146 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCCP43146 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCCP43146 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCCP43146 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCCP43146 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCCP43146 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCCP43146 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCCP43146 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCCP43146 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
DCCP43146 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCCP43146 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCCP43146 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCCP43146 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCCP43146 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCCP43146 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCCP43146 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCCP43146 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCCP43146 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCCP43146 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCCP43146 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCCP43146 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCCP43146 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCCP43146 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCCP43146 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
DCCP43146 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCCP43146 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCCP43146 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCCP43146 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCCP43146 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCCP43146 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCCP43146 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCCP43146 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
DCCP43146 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DCCP43146 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DCCP43146 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
DCCP43146 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
DCCP43146 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCCP43146 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCCP43146 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCCP43146 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCCP43146 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
DCCP43146 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCCP43146 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCCP43146 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCCP43146 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCCP43146 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCCP43146 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCCP43146 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCCP43146 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCCP43146 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCCP43146 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DCCP43146 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCCP43146 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCCP43146 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCCP43146 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DCCP43146 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCCP43146 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
DCCP43146 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
DCCP43146 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCCP43146 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCCP43146 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCCP43146 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCCP43146 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCCP43146 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCCP43146 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCCP43146 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCCP43146 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCCP43146 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCCP43146 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCCP43146 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCCP43146 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCCP43146 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCCP43146 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
DCCP43146 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms