Protein–RNA interactions for Protein: P29762

CRABP1, Cellular retinoic acid-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRABP1P29762 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CRABP1P29762 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms