Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GCAP28676 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GCAP28676 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCAP28676 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCAP28676 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCAP28676 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
GCAP28676 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCAP28676 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCAP28676 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCAP28676 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCAP28676 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCAP28676 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCAP28676 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCAP28676 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCAP28676 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCAP28676 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCAP28676 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCAP28676 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
GCAP28676 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCAP28676 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCAP28676 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCAP28676 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCAP28676 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCAP28676 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCAP28676 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCAP28676 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCAP28676 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCAP28676 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCAP28676 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCAP28676 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCAP28676 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCAP28676 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
GCAP28676 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCAP28676 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCAP28676 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCAP28676 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCAP28676 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCAP28676 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCAP28676 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCAP28676 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCAP28676 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCAP28676 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCAP28676 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCAP28676 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCAP28676 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
GCAP28676 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCAP28676 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCAP28676 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCAP28676 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCAP28676 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCAP28676 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCAP28676 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCAP28676 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCAP28676 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCAP28676 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCAP28676 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCAP28676 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCAP28676 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCAP28676 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCAP28676 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCAP28676 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCAP28676 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCAP28676 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCAP28676 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCAP28676 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCAP28676 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCAP28676 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCAP28676 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GCAP28676 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCAP28676 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCAP28676 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCAP28676 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCAP28676 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
GCAP28676 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
GCAP28676 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GCAP28676 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GCAP28676 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GCAP28676 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GCAP28676 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GCAP28676 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
GCAP28676 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GCAP28676 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
GCAP28676 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCAP28676 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCAP28676 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCAP28676 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCAP28676 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCAP28676 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCAP28676 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCAP28676 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCAP28676 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCAP28676 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCAP28676 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCAP28676 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCAP28676 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCAP28676 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCAP28676 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCAP28676 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCAP28676 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
GCAP28676 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms