Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
MYF6P23409 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MYF6P23409 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYF6P23409 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYF6P23409 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYF6P23409 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYF6P23409 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYF6P23409 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYF6P23409 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYF6P23409 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYF6P23409 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYF6P23409 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYF6P23409 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYF6P23409 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYF6P23409 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYF6P23409 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MYF6P23409 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYF6P23409 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MYF6P23409 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYF6P23409 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MYF6P23409 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYF6P23409 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYF6P23409 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYF6P23409 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYF6P23409 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MYF6P23409 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms