Protein–RNA interactions for Protein: P17658

KCNA6, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 6, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA6P17658 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KCNA6P17658 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
KCNA6P17658 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.8 ms