Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSPP15924 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSPP15924 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSPP15924 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSPP15924 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DSPP15924 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DSPP15924 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSPP15924 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSPP15924 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSPP15924 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DSPP15924 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSPP15924 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSPP15924 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSPP15924 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSPP15924 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSPP15924 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSPP15924 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSPP15924 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSPP15924 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSPP15924 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DSPP15924 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DSPP15924 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSPP15924 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSPP15924 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSPP15924 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSPP15924 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DSPP15924 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DSPP15924 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSPP15924 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSPP15924 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSPP15924 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DSPP15924 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DSPP15924 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSPP15924 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSPP15924 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSPP15924 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSPP15924 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSPP15924 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSPP15924 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSPP15924 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSPP15924 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSPP15924 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSPP15924 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSPP15924 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSPP15924 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DSPP15924 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSPP15924 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSPP15924 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSPP15924 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSPP15924 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSPP15924 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSPP15924 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSPP15924 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSPP15924 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSPP15924 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DSPP15924 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSPP15924 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSPP15924 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSPP15924 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSPP15924 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DSPP15924 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSPP15924 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSPP15924 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSPP15924 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DSPP15924 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSPP15924 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSPP15924 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DSPP15924 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSPP15924 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSPP15924 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSPP15924 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSPP15924 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSPP15924 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSPP15924 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSPP15924 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSPP15924 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DSPP15924 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSPP15924 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSPP15924 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSPP15924 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSPP15924 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSPP15924 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DSPP15924 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSPP15924 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DSPP15924 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSPP15924 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSPP15924 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSPP15924 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSPP15924 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSPP15924 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DSPP15924 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSPP15924 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSPP15924 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSPP15924 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSPP15924 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSPP15924 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSPP15924 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSPP15924 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSPP15924 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DSPP15924 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms