Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD8BP10966 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD8BP10966 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD8BP10966 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CD8BP10966 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD8BP10966 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD8BP10966 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD8BP10966 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CD8BP10966 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD8BP10966 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD8BP10966 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD8BP10966 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD8BP10966 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD8BP10966 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD8BP10966 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD8BP10966 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD8BP10966 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD8BP10966 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CD8BP10966 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CD8BP10966 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CD8BP10966 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CD8BP10966 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD8BP10966 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD8BP10966 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD8BP10966 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD8BP10966 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD8BP10966 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD8BP10966 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD8BP10966 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD8BP10966 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD8BP10966 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD8BP10966 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD8BP10966 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD8BP10966 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD8BP10966 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD8BP10966 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD8BP10966 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD8BP10966 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD8BP10966 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD8BP10966 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CD8BP10966 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD8BP10966 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD8BP10966 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD8BP10966 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CD8BP10966 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD8BP10966 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD8BP10966 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD8BP10966 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD8BP10966 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD8BP10966 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CD8BP10966 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD8BP10966 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD8BP10966 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD8BP10966 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD8BP10966 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CD8BP10966 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CD8BP10966 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CD8BP10966 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms