Protein–RNA interactions for Protein: P04280

PRB1, Basic salivary proline-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRB1P04280 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PRB1P04280 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRB1P04280 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRB1P04280 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRB1P04280 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRB1P04280 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRB1P04280 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRB1P04280 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRB1P04280 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRB1P04280 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRB1P04280 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRB1P04280 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRB1P04280 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRB1P04280 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRB1P04280 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRB1P04280 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRB1P04280 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRB1P04280 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRB1P04280 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRB1P04280 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRB1P04280 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRB1P04280 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRB1P04280 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRB1P04280 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRB1P04280 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRB1P04280 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRB1P04280 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRB1P04280 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRB1P04280 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRB1P04280 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRB1P04280 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRB1P04280 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRB1P04280 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRB1P04280 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PRB1P04280 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRB1P04280 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRB1P04280 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRB1P04280 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PRB1P04280 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRB1P04280 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRB1P04280 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRB1P04280 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRB1P04280 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRB1P04280 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRB1P04280 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRB1P04280 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRB1P04280 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRB1P04280 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRB1P04280 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRB1P04280 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRB1P04280 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRB1P04280 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRB1P04280 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRB1P04280 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRB1P04280 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRB1P04280 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRB1P04280 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRB1P04280 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRB1P04280 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRB1P04280 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRB1P04280 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRB1P04280 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRB1P04280 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRB1P04280 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PRB1P04280 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRB1P04280 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRB1P04280 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRB1P04280 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRB1P04280 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRB1P04280 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PRB1P04280 ZFR2-208ENST00000592398 532 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms