Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
POLR1AO95602 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms