Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
E2F6O75461 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2F6O75461 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2F6O75461 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2F6O75461 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2F6O75461 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2F6O75461 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2F6O75461 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2F6O75461 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
E2F6O75461 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F6O75461 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F6O75461 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F6O75461 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F6O75461 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F6O75461 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F6O75461 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F6O75461 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F6O75461 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F6O75461 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F6O75461 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F6O75461 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F6O75461 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F6O75461 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F6O75461 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F6O75461 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F6O75461 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F6O75461 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F6O75461 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F6O75461 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F6O75461 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F6O75461 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F6O75461 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F6O75461 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F6O75461 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F6O75461 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F6O75461 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F6O75461 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F6O75461 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F6O75461 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F6O75461 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F6O75461 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F6O75461 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
E2F6O75461 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F6O75461 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F6O75461 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F6O75461 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F6O75461 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F6O75461 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F6O75461 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F6O75461 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F6O75461 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F6O75461 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F6O75461 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F6O75461 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F6O75461 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F6O75461 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F6O75461 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F6O75461 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F6O75461 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F6O75461 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F6O75461 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F6O75461 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F6O75461 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F6O75461 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F6O75461 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F6O75461 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F6O75461 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F6O75461 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F6O75461 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F6O75461 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F6O75461 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F6O75461 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F6O75461 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
E2F6O75461 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F6O75461 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F6O75461 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F6O75461 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F6O75461 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F6O75461 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F6O75461 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F6O75461 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F6O75461 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F6O75461 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F6O75461 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F6O75461 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F6O75461 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F6O75461 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F6O75461 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F6O75461 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F6O75461 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F6O75461 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F6O75461 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F6O75461 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F6O75461 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F6O75461 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F6O75461 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F6O75461 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F6O75461 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F6O75461 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
E2F6O75461 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms