Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNA1GO43497 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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