Protein–RNA interactions for Protein: B2RD01

CENPBD1, CENPB DNA-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBD1B2RD01 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CENPBD1B2RD01 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CENPBD1B2RD01 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms