Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CCDC78A2IDD5 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CCDC78A2IDD5 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms