Protein–RNA interactions for Protein: V9GY05

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GY05 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GY05 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GY05 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GY05 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GY05 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GY05 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GY05 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GY05 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GY05 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GY05 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GY05 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GY05 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GY05 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GY05 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GY05 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GY05 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GY05 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GY05 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GY05 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GY05 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GY05 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GY05 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GY05 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GY05 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GY05 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GY05 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GY05 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GY05 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GY05 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GY05 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GY05 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GY05 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GY05 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GY05 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GY05 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GY05 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GY05 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GY05 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GY05 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GY05 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
V9GY05 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GY05 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GY05 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GY05 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GY05 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GY05 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GY05 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GY05 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GY05 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GY05 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GY05 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GY05 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GY05 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GY05 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GY05 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GY05 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GY05 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GY05 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GY05 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GY05 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GY05 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GY05 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GY05 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GY05 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GY05 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GY05 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GY05 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GY05 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GY05 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GY05 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GY05 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GY05 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GY05 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GY05 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GY05 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GY05 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GY05 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GY05 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GY05 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
V9GY05 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
V9GY05 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
V9GY05 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
V9GY05 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
V9GY05 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
V9GY05 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
V9GY05 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
V9GY05 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
V9GY05 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
V9GY05 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
V9GY05 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
V9GY05 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
V9GY05 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
V9GY05 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
V9GY05 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
V9GY05 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
V9GY05 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
V9GY05 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
V9GY05 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
V9GY05 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
V9GY05 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms