Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
APOBEC2Q9Y235 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms