Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TRIM35Q9UPQ4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TRIM35Q9UPQ4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms