Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
USP18Q9UMW8 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
USP18Q9UMW8 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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