Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
TUBE1Q9UJT0 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
TUBE1Q9UJT0 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms