Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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RABGEF1Q9UJ41 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
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RABGEF1Q9UJ41 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RABGEF1Q9UJ41 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RABGEF1Q9UJ41 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RABGEF1Q9UJ41 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RABGEF1Q9UJ41 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RABGEF1Q9UJ41 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RABGEF1Q9UJ41 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RABGEF1Q9UJ41 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABGEF1Q9UJ41 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABGEF1Q9UJ41 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABGEF1Q9UJ41 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABGEF1Q9UJ41 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABGEF1Q9UJ41 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABGEF1Q9UJ41 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABGEF1Q9UJ41 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABGEF1Q9UJ41 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABGEF1Q9UJ41 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABGEF1Q9UJ41 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABGEF1Q9UJ41 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABGEF1Q9UJ41 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABGEF1Q9UJ41 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABGEF1Q9UJ41 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
RABGEF1Q9UJ41 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABGEF1Q9UJ41 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABGEF1Q9UJ41 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABGEF1Q9UJ41 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABGEF1Q9UJ41 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RABGEF1Q9UJ41 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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