Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CHPF2Q9P2E5 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CHPF2Q9P2E5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms