Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCDC88CQ9P219 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms