Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MIS18AQ9NYP9 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
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