Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
MS4A12Q9NXJ0 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms