Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RRP7BPQ9NSQ0 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RRP7BPQ9NSQ0 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms