Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LHX9Q9NQ69 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms