Protein–RNA interactions for Protein: Q9HBJ7

USP29, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 29, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP29Q9HBJ7 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
USP29Q9HBJ7 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms