Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
TRIM55Q9BYV6 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
TRIM55Q9BYV6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms