Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDZD11-201ENST00000239666 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL5-202ENST00000370321 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011997.1-201ENST00000409845 1032 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC01715-201ENST00000420776 624 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 DSCR10-201ENST00000432141 860 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSFY7P-201ENST00000432672 318 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSFY8P-201ENST00000437934 318 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC114495.2-201ENST00000452686 437 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC020699.1-201ENST00000505161 445 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 ELL2P2-201ENST00000515135 694 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP003043.1-201ENST00000527804 547 ntTSL 4 BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 TPT1-AS1-221ENST00000618947 520 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL162390.1-201ENST00000622201 1246 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC106730.3-201ENST00000624568 641 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 TTN-AS1-268ENST00000629094 604 ntTSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC8.05□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 CIR1P2-201ENST00000514821 1342 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 ACTR3C-201ENST00000252071 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC8.04□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC135068.1-201ENST00000332663 1084 ntAPPRIS P1 BASIC8.04□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC8.04□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC8.04□□□□□ -1.12
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC8.04□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms