Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.4 ms