Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SPOCK3Q9BQ16 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.1 ms