Protein–RNA interactions for Protein: Q96M91

CFAP53, Cilia- and flagella-associated protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP53Q96M91 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP53Q96M91 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP53Q96M91 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP53Q96M91 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP53Q96M91 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP53Q96M91 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP53Q96M91 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP53Q96M91 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CFAP53Q96M91 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CFAP53Q96M91 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms