Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SIRT1Q96EB6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms