Protein–RNA interactions for Protein: Q96E40

SPACA9, Sperm acrosome-associated protein 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPACA9Q96E40 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SPACA9Q96E40 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms