Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
RFT1Q96AA3 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RFT1Q96AA3 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms