Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMPDL3AQ92484 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMPDL3AQ92484 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMPDL3AQ92484 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMPDL3AQ92484 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SMPDL3AQ92484 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms