Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTU0

DDI1, Protein DDI1 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDI1Q8WTU0 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DDI1Q8WTU0 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms