Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms