Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBP5

MFSD9, Major facilitator superfamily domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD9Q8NBP5 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MFSD9Q8NBP5 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MFSD9Q8NBP5 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MFSD9Q8NBP5 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MFSD9Q8NBP5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MFSD9Q8NBP5 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MFSD9Q8NBP5 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MFSD9Q8NBP5 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MFSD9Q8NBP5 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MFSD9Q8NBP5 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MFSD9Q8NBP5 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MFSD9Q8NBP5 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MFSD9Q8NBP5 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MFSD9Q8NBP5 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MFSD9Q8NBP5 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MFSD9Q8NBP5 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MFSD9Q8NBP5 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MFSD9Q8NBP5 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
MFSD9Q8NBP5 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms