Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CCDC63Q8NA47 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms