Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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C9orf40Q8IXQ3 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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C9orf40Q8IXQ3 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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C9orf40Q8IXQ3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
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C9orf40Q8IXQ3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
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C9orf40Q8IXQ3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
C9orf40Q8IXQ3 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
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