Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV32

CCDC71, Coiled-coil domain-containing protein 71, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC71Q8IV32 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CCDC71Q8IV32 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC71Q8IV32 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC71Q8IV32 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC71Q8IV32 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC71Q8IV32 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CCDC71Q8IV32 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC71Q8IV32 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC71Q8IV32 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC71Q8IV32 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC71Q8IV32 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC71Q8IV32 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC71Q8IV32 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC71Q8IV32 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CCDC71Q8IV32 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms