Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYE7

NHSL1, NHS-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,610 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHSL1Q5SYE7 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NHSL1Q5SYE7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NHSL1Q5SYE7 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms